《指南》力求彰顯指導性、針對性、實效性，具有以下特點：（1）強調價值性和科學性的統一，既突出正確的價值導向，又體現合理的科學要求；（2）突出問題導向和針對性，針對科研評價的現實問題，從各個環節提出改進建議；（3）指導性與操作性相結合，既有抽象的原則要求，又有具體的參考辦法；（4）體現依法改進、依法管理，追求科研評價的制度化和規范化。
《指南》由6章正文和3個附錄組成。第1章“導言”，論述了科研評價的重要價值、現存問題和相關概念。第2章“評價的思想導向和基本原則”，概括了評價的思想導向、基本原則，及落實要點。第3章“評價標準和指標體系的確定”，提出了科研評價的一般標準、分類標準和評價指標。第4章“評價方法和程序設計”，論述了評價方法的基本類型和選擇規則、應用要點和程序設計。第5章“評價制度和組織實施”，闡述了重點評價制度的建設、評價制度設計的要點與評價的組織實施。第6章“結語”，從理念、機制、方法和文化四個方面提出了改進高校評價工作的重點任務。附錄部分則收錄了教育部有關科研評價改革的文件，以及部分高校有代表性的評價方法。
《指南》適用于全國高校哲學社會科學研究人員、研究機構、研究項目、研究成果的評價工作，對高校的人事考評、職稱評定、學科評審、學位認定等，也具有重要的參考價值。《指南》的出版發行，有助于提高科研評價活動的科學性、公正性、有效性，營造良好的學術環境，提升研究質量和創新能力，促進高校哲學社會科學的健康發展。
